Es wurde 1925 als Heimatmuseum des damaligen Kreises Büren eröffnet. Zwischen 1934 und 1945 befand sich die Wewelsburg im Besitz der SS, die hier ein Versammlungszentrum für Ihre obersten Offiziere errichten wollte. Nach dem Zweiten Weltkrieg als Kreismuseum wiederhergestellt, umfasst es heute das „Historische Museum des Hochstifts Paderborn“ (Geschichte des Paderborner Landes bis zur erstmaligen Eingliederung des früheren Fürstbistums Paderborn in das Königreich Preußen 1802/03) sowie die „Erinnerungs- und Gedenkstätte Wewelsburg 1933 – 1945“ mit der Dauerausstellung „Ideologie und Terror der SS“.