In der Weserstadt ist der „Preußische Nebenbahnzug“ das Markenzeichen dieser Museumseisenbahn; er repräsentiert somit die Epoche I der deutschen Eisenbahngeschichte. Am anderen Standort sind Fahrzeuge der Epoche III versammelt, d.h. Baujahre ab den 1920/30er Jahren, die noch Jahrzehnte später ihren Dienst taten. Da Neben- und Kleinbahnbetrieb inszeniert wird, handelt es sich fast ausschließlich um zweiachsige Personenwaggons mit offenen Plattformen und entsprechende Lokomotiven.

Der „Mindener Preußenzug“ ist in seiner Gesamtheit einzigartig in der Bundesrepublik Deutschland. Die Dampflokomotiven sind zwischen 1908 und 1912 gebaut worden und entsprechend in den preußischen Länderbahnfarben dunkelgrün/dunkelrot mit Zierlinien lackiert. Die Wagen erscheinen den Klassen gemäß grün (2. Kl.), braun (3.) oder grau (4.). Sie wurden nach Originalzeichnungen aufwendig restauriert, was MEM die Anerkennung von Fachleuten aus dem Bereich des Denkmalschutzes einbrachte. MEM hat drei Tenderloks im Bestand, zehn Sitz- und Packwagen, dazu einige Güterwagen für den Fahrrad- und Kohletransport.